El professor Fullola imparteix assignatures de l’àrea de Prehistòria a la Universitat de Barcelona des de l’any 1975. Al llarg de tots aquests anys n’ha fet dels tres cicles i també he impartit diversos màsters i postgraus a la pròpia UB i a altres universitats espanyoles. Actualment imparteix la primera part de l’assignatura “Prehistòria”, obligatòria als Graus d’Història i d’Arqueologia a la UB. Ha dirigit una quinzena de tesis doctorals, ha impartit més d’un centenar de conferències, ha publicat una seixantena de treballs presentats a congresos i prop de cent vint articles en revistes científiques, mérs d’un centenar de treballs menors i una trentena de llibres, entre autoria i edició.

Ha estat secretari (1986-1988) i després director (1988-1991) del Dept. de Prehistòria, Història Antiga i Arqueologia de la UB, i membre del Consell d’Estudis d’Història entre 2001 i 2004. És membre de la Junta Consultiva de la UB des de gener de 2004, i de la Comissió de Política Científica des de gener de 2006. Igualment va formar part de la comissió que va elaborar l’Estatut de la UB (2002-2003). És president de l’Associació de Catedràtics de la UB des del 1999.
En relació amb la gestió de l’arqueología, va formar part de la Comissió Assessora del Servei d’Arqueologia de la Generalitat de Catalunya entre els anys 1983 i 2001. Igualment és vicepresident de la Societat Catalana d’Arqueolgia des del 1998. A nivell internacional és membre (des de 1991) i secretari (des de 2006) de de la Comissió VIII de la Unió Internacional de Ciències Prehistòriques i Protohistòriques sobre Paleolític Superior. També és membre del Comité des Travaux Historiques et Scientifiques del Ministère de la Jeunesse, de l’Éducation nationale et de la Recherche de França, des de 2005, i de la Société Préhistorique Française des de 1976.
En aspectes relacionats amb l’avaluació de la recerca i de la docència, va ser membre (1995-1996) i president (1997) de la Comissió 10, d’Història i Art, de la Comisión Nacional de Evaluación de la Actividad Investigadora del Ministerio de Educación y Ciencia. També va ser membre (2004) i president (2005-2008) comissió específica d’avaluació de la recerca (acreditació com a professors agregats) i de la comissió específica d’avaluació de la recerca avançada (acreditació com a catedràtics) de l’AQU en l’àmbit d’Humanitats. Ha estat membre de la Comisión de Acreditación Nacional para el acceso al cuerpo de Catedráticos de Universidad, nomenat pel Consejo Nacional de Universidades, des de 2007 a 2009.

La seva línia de recerca principal ha esta sempre l’estudi de les societats de caçadors-recol·lectors, ja sigui en el paleolític, ja en grups que visqueren en època històrica. Tot i que la direcció d’excavacions i de proyectes l’ha portat a conrear la visió global dels fenòmens materials, paleoambientals, socials i econòmics d’aquelles poblacions, lel seu intrès particular s’ha centrat en l’estudi del útils de sílex des del punt de vista tipológic i tecnològic. Des del 1985 ha estat consecutivament IP de diversos proyectes finançats des dels diferents ministeris a Madrid; i igualment ha estat l’IP del Grup de Recerca de Qualitat del SERP, reconegut per la Generalitat de Catalunya des del 1993.

La direcció d’excavacions l’ha exercit des del 1976, quan ho feu a la cova del Barranc Blanc (Rótova, València) Després ja vingueren, a partir del 1978, l’abric del Filador, la cova del Boix i l’abric dels Colls (Margalef de Montsant), la cova del Parco (Alòs de Balaguer), des del 1987 i Monlleó (Prats i Sansor), des del 2000. A l’estranger destaquen les intervencions a la Baixa Califòrnia mexicana entre 1990 i 1992 a La Cueva i la Cueva del Ratón (San Francisco de la Sierra), i la que codirigí a la vall del Coã, a Portugal, amb diverses excavacions entre 1999 i 2001.

Els aspectes relacionats amb la historiografia els va començar a tocar el 2002, amb especial incidència en la història de la prehistòria a nivell català i espanyol. També en el camp de la recerca històrica universitària destaca la seva publicació, com a coordinador juntament amb els Drs. Gracia i Casassas, dels dos volums de la Història de la UB (2008 i 2010).

La divulgació de la prehistòria ha estat una altra de les seves línies proritàries, amb especial esment en dues obres com La puerta del pasado. La vida cotidiana del hombre prehistórico en la península ibérica (1998, ed. Martínez Roca) i Tal como éramos (ed. Ariel, 2005), ambdues com a coordinador amb M. Àngels Petit. També ha publicat manuals universitaris, com la Introducción a la Prehistoria: la evolución de la cultura humana (ed. UOC, 2005), amb J. Nadal.

Com a producte de les recerques fetes des del SERP, el professor Fullola ha impulsat, amb un grup d’altres membres del grup, la línia editorial de la Monografies del SERP, que fet aparèixer des de 1996 vuit volums d’aquesta sèrie. Igualment figura com a editor dels dos grans congressos internacionals de la UISPP que ha organitzat, el de Banyoles El món mediterrani després del Pleniglacial (18.000-12.000 BP), aparegut el 1997 (en col·laboració amb N. Soler), i el de Nerja La cuenca mediterránea durante el Paleolítico Superior (38.000 – 10.000 años), aparegut el 2006 (en col·laboració amb J.L. Sanchidrián i A.M. Márquez)

BERGADÀ, M.M., BURJACHS, F. i FULLOLA, J.M., 1999 .- “Evolution paléoenvironnementale du 14.500 à 10.000 BP dans les Pré-Pyrénées catalans: la grotte du Parco (Alòs de Balaguer, Lleida, Espagne)”, a L’Anthropologie, t.103, nº2, pàg 249-264, 8 fig., 2 taules, París.

DAURA, J., SANZ, M., PIKE, A.W.G., SUBIRÀ, M.E., FORNÓS, J.J., FULLOLA, J.M., JULIÀ, R. i ZILHÃO, J., 2010: “Stratigraphic context and direct dating of the Neandertal mandible from Cova del Gegant (Sitges, Barcelona)”, a Journal of Human Evolution, 59 (1), pàg 109-122, 8 fig, 5 taules.

FULLOLA, J.M., 1978 .- "El Solútreo-gravetiense o Parpallense, industria mediterránea", Zephyrus XXVIII-XXIX, pàg 113-123, Salamanca.

FULLOLA, J.M., 1979 .- “Las industrias líticas del Paleolítico Superior ibérico" ed.Servicio de Investigación Prehistórica de la Diputación Provincial de Valencia, serie Trabajos Varios n.60, 262 pàg, 61 fig., 4 quadres, València.

FULLOLA, J.M., 1983 .- "Le Paléolithique Supérieur dans la zone méditerranéenne ibèrique", L'Anthropologie, tomo 87, 3, pàg 339-352, 1 mapa, 5 fig., París.

FULLOLA, J.Mª, BERGADÀ, M.M., BURJACHS, F., Gª-ARGÜELLES, P., NADAL, J. i SOLER, N., 1999 .- “Le Paléolithique Supérieur méditerranéen ibérique; approches paléoenvironnamentales, industrielles et artistiques”, Les faciès leptolithiques du Nord-Ouest méditerranéen: milieux naturels et culturels, actes del XXIV Congrès Préhistorique de France, Carcassona, setembre 1994, D. Sacchi dtor., ed. Société Préhistorique Française, pàg 49-78, 5 fig., 3 taules, Carcassona.

FULLOLA, J.M., CASTILLO, V.del, PETIT, M.A. i RUBIO, A., 1994 .- “Premières datations de l’art rupestre de Basse Californie (Mexique). The first rock art datings in Lower California (Mexico)”, a International Newsletter On Rock Art, nº 9, pp 1-4,1 fig., Foix.

FULLOLA, J.M. i NADAL, J., 2005 .- “Introducción a la Prehistoria: la evolución de la cultura humana”, ed.UOC, sèrie Humanidades, 214 pàg, Barcelona.

FULLOLA, J.M., ROMÁN, D., SOLER, N. i villaverde, V., 2008 .- «Le Gravettien de la côte méditerranéenne ibérique », Paléo 19, desembre 2007, pàg 73-88, 6 fig., 1 taula.

FULLOLA, J.M. i SERRALLONGA, J., 2000 .- “Reflections on the main events and changing factors in the evolution of human behaviour. Present problems of change in human beings from an evolutionary perspective”, Human Evolution, vol.15, n.1-2 Evolution of the human family, pàg 113-120.

GARCÍA-ARGÜELLES, P., NADAL, J., i FULLOLA, J.M., 2009.- “From Magdalenian to Early Neolithic: hunter-gatherers in transition in north-eastern Iberia”, a Mesolithic Horizonts, Papers presented at the7th International Conference on the Mesolithic in Europe, Belfast, Sinéad McCartan, Rick Schulting, Graeme Warren i Peter Woodmen (eds.), Oxbow ed., pàg 500-506, 3 fig, Oxford

GRÀCIA, F. i FULLOLA, J.M., 2006 .- “El sueño de una generación. El Crucero Universitario por el Mediterráneo de 1933”, edicions de la Universitat de Barcelona, 534 pàg, Barcelona.

GRÀCIA, F., FULLOLA, J.M. i VILANOVA, F., 2002 .- “58 anys i 7 dies. Correspondència de Pere Bosch Gimpera a Lluís Pericot”, ed. SERP, Univ. de Barcelona i Fundació Bosch i Gimpera, 474 pàg, 1469 notes, índex onomàstic, Barcelona.

PETIT, M.A. i FULLOLA, J.M., 2005 .- “Tal como éramos”, en col.laboració amb Ballart, J., Bergadà, M.M., Cebrià, A., Gª-Argüelles, P., Juan, J., López Cachero, J., Mangado, X., Medina, V., Nadal, J., Rincón, M.A. i Serrallonga, J., ed. Ariel, 299 pàg, Barcelona.

VILLAVERDE, V. i FULLOLA, J.M. 1990 .- "Le Solutréen de la zone méditerranéenne espagnole", a Feuilles de pierre, actes del Col.loqui Intenacional sobre les indústries de puntes foliàcies del Paleolític Superior europeu, org. UISPP, Cracòvia, setembre 1989, ed.ERAUL nº42, pàg 467-484, Lieja.