El estudio de la dinámica de los sistemas bentónicos requiere el análisis de la estructura poblacional y la conectividad entre poblaciones, así como de los procesos que han dado lugar a la distribución actual de las especies y la evolución en grupos concretos. La utilización de marcadores moleculares es la herramienta más informativa para analizar estos patrones.

Nuestro grupo trabaja activamente en el estudio de la estructura genética de diversas especies de esponjas, ascidias y equinodermos, usando secuencias de ADN mitocondrial y nuclear y microsatélites. Una atención especial se dedica al estudio de las conexiones y flujo génico entre atlántico y mediterráneo, así como a la estructura genética temporal de especies con cohortes identificables.