Las actividades del Banco de Hongos Comestibles y Medicinales se iniciaron a finales del año 1999. El objetivo primario era crear una colección de hongos que fuera útil en la investigación interna del Departament de Biologia Vegetal de la Facultat de Biologia, pero que simultáneamente fuera interesante para otros investigadores en micologia aplicada.
El tiempo ha dilatado esta perspectiva y, hoy día, el BEMF mantiene dos tipos de depositos que incluyen: