Les activitats del Banc de Fongs Comestibles i Medicinals vàren iniciar-se a finals de l'any 1999. L'objectiu primer era crear una col·lecció de fongs que fós útil en la recerca interna del Departament de Biologia Vegetal de la Facultat de Biologia, però que alhora fós d'interès per a altres estudiosos de micologia aplicada.

El temps ha dilatat aquestes perspectives i, actualment, el BEMF manté dos tipus de dipòsits que inclouen:


 Fongs comestibles o amb propietats medicinals, sense limitació geogràfica

 Fongs recollits en territori català


Actualment la col·lecció supera els 700 aïllats, mantinguts majoritàriament en tubs d'agar inclinat.