Des de fa més de 10 anys que la Universitat de Barcelona, juntament amb la Universitat Politècnica de Catalunya i el Consejo Superior de Investigaciones Científicas, ofereix uns estudis de doctorat en Ciències del Mar. D'una manera molt sintètica, aquest doctorat té com a objectiu principal donar una especialització en l'estudi del mar a llicenciats de diferents disciplines, formació científica, tècnica i professional. Es contemplen les següents especialitats: Geologia Marina, Gestió Costanera, Enginyeria Costanera, Oceanografia Biològica, Oceanografia Física i Oceanografia Química.

En la actualitat (curs 2007-2008) està vigent el segon any del Programa de Doctorat del bienni 2006-2008, que es regeix pel decret RD 778/1998, que només serveix pels qui ja havien iniciat els estudis de tercer cicle l'any passat o anteriors, i es pot iniciar el nou doctorat de Ciències del Mar seguint la via regulada pel RD 56/2005, adequada a criteris de convergència europea, que contempla la necessitat de superar 300 crèdits ECTS dels quals 60 han de ser assolits en el marc d'un programa oficial de postgrau.