"Entre los temas que más dividen a todas las sociedades contemporáneas se encuentran los relacionados con las formas de organización familiar, los diversos papeles del género y la conducta sexual. Es un error pensar que las divergencias y polémicas sean por completo nuevas: la poligamia, el concubinato, la prostitución ritual, la circuncisión y la homosexualidad son asuntos sobre los que se ha discutido durante milenios. Las culturas y las religiones se han distinguido entre sí por realizar en estos asuntos prácticas diferentes, y por criticar las prácticas de las "otras". Sin embargo el dominio masculino prácticamente universal ha establecido los límites de lo que se podía discutir sobre esta cuestión (y sobre quién podía participar en la discusión). Hoy en día estos límites se ponen en cuestión debido a la amplia aceptación de las ideas relativas a la igualdad y a los derechos humanos. Ahora todo está abierto al debate, todas las religiones y las culturas se ven sometidas a revisión crítica, a veces se contribuye así a la tolerancia, pero en otras ocasiones se produce lo contrario" (Walzer, Michael Tratado sobre la tolerancia p. 72-73).

La principal problemática en las cuestiones de género se plantea en casos como la clitoridectomía (mutilación genital en las mujeres), cuando hay argumentaciones contrapuestas respecto a si deben o no de permitirse tales prácticas. En contra de estas prácticas (que, principalmente se dan en África) hay una oposición activa por parte de organizaciones que trabajan en la sociedad civil internacional. Países como Suecia, Suiza y Gran Bretaña consideran ilegales tales prácticas, aunque no se haga ningún esfuerzo para su prohibición efectiva. El argumento a favor de tolerar tales costumbres se apoya en "el respeto por la diversidad cultural", así, en 1989, en Francia se planteaba una petición contra el hecho de considerar como delito lo que los franceses llaman excisión: "poner una condena penal por una costumbre que no amenaza el orden republicano, y sin que haya razones para considerarla fuera de la esfera de la elección privada, como ocurre con la circuncisión, demostraría una actitud intolerante que solamente crearía un drama humano mayor que el que pretende evitar, y manifestaría con ello una concepción particularmente estrecha de la democracia" (Walzer, Michael Tratado sobre la tolerancia p. 75).

Walzer está en contra de la aceptación de estas prácticas en nombre de la tolerancia hacia la diversidad cultural. No cree que esto deba ser considerado una práctica privada. También debe tenerse en cuenta que las jóvenes no se someten a estas operaciones voluntariamente. La tolerancia comporta el derecho a la reproducción de la comunidad. Pero este derecho entra en conflicto con el derecho de los ciudadanos individuales. Parece inevitable que, a largo plazo, sean los derechos individuales los que se lleven la victoria, porque una ciudadanía igual es una norma básica para el Estado nacional.