Áurea
Navarro y Gabriel Pons
Objetivo general:
Mostrar
las posibilidades que ofrecen las bases de datos actuales ubicadas en internet para
la obtención de información útil en biologia molecular y en general para el
estudio y la investigación biomédica.
Resumen:
La
cantidad brutal de información biomédica que se ha ido generando estos últimos
10 años obliga a la utilización de la informática para un óptimo
aprovechamiento de tanta información. Por otra parte la consulta de información
sobre secuencias genómicas, de proteínas o sobre la estructura de proteínas
hace ineludible la utilización de internet y los programas auxiliares que permiten
la comparación de secuencias. Existen
múltiples direcciones internet donde consultar por ejemplo la literatura
científica que va apareciendo. La universidad de Barcelona dispone de bases de
datos medline en cdroms consultables por red a partir de la dirección de la
biblioteca:
Sin
embargo, la dirección más completa y actualizada sobre bibliografia, genomas,
etc es la de los “National Institutes of Health”:
http://ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi
En
esta dirección se pueden realizar consultas sobre artículos, genes, proteínas,
estructura de proteínas y genomas, con links cruzados. Los abstracts de los
artículos contienen links en muchos casos a la dirección de la revista
correspondiente desde donde se puede obtener una copia completa del artículo
siempre que la suscripción sea gratuita y si nos conectamos desde una
institución que posee una subscripción electrónica a la revista. La Universidad
de Barcelona está actualmente suscrita a más de 2000 revistas. Dentro del campo
de la biologia molecular están cubiertas la mayoría de las más importantes. Una
ventaja adicional de los archivos electrónicos es que permite la captación y
edición de las figuras de los artículos para presentaciones, docencia, etc.
SERVIDOR
PARA TRABAJAR Y GUARDAR DATOS: BIOLOGY WORKBENCH
Direcciones
interesantes de bancos de datos adicionales:
Banco
de datos muy completo sobre proteínas: secuencias, dominios, homologías, etc.
También contiene herramientas para experimentos de proteómica, geles
bidimensionales y muchas otras utilidades.
Banco
de datos genómico para búsquedas de secuencias
permite
la búsqueda de homologías con nuestra secuencia frente al genbank, tanto de
proteinas como de genomas
http://rcsb.icm.edu.pl/oca-bin/pdblite
base
de datos para la obtención de estructura tridimensionales
PROGRAMA DE
VISUALIZACION JMOL
Programa
para visualizar moléculas
CONSURF. Visualizacion por homología
Movimiento molecular de la
glucoquinasa al unirse al sustrato