Hi ha vàries maneres d’avaluar el treball fer en un REI. Per exemple demanar que cada grup d’estudiants elabori un informe final d’indagació, acompanyada o no d’una defensa oral. L’informe també pot ser individual, o incloure una part comuna i una d’individual. Es pot preguntar sobre la resposta final a la qüestió generatriu del REI, però també sobre el procés seguit per elaborar-la. Sovint l’informe final arriba com una prolongació dels diaris d’aula (o quaderns de bitàcola) elaborats pels estudiants durant el procés d’indagació.

Una altra opció, més propera a les activitats habituals, consisteix a plantejar als estudiants un examen escrit individual on se’ls demana que expliquin i ampliïn algun aspecte o qüestió derivada abordada durant el procés d’indagació. La prova pot ser amb documents ja elaborats, amb documents nous proporcionats pel professorat o sense documentació. Aquest tipus de prova individual pot ajudar a completar la qualificació dels informes quan són grupals.

Finalment, es pot afegir una nota de participació a classe que reflecteixi el compromís tant individual com col·lectiu de treball d’aula.