Universidad de Barcelona

Máster en Genética y Genómica

Prácticas del Máster

El Master en Genética y Genómica es un máster con una extensa dedicación práctica. Hay varias asignaturas prácticas y otras que incorporan en su programa docente trabajos prácticos y visitas guiadas a grandes equipamientos científicos.

Además, el grueso del trabajo práctico se focaliza en los 30 créditos ECTS del Trabajo Final de Máster TFM, que se hace en un laboratorio de investigación especializado. Visita Trabajo Final de Máster para obtener información y lugares donde escoger para hacer la búsqueda de tu TFM.

Ejemplos de asignaturas con trabajos prácticos

Advanced Techniques of Genetic Engineering

This course will provide an overview on the most recent advances in Genetic Engineering,  focusing on CRISPR/Cas-related applications. The subject will include 1) lectures on Genetic engineering in various model organisms 2) a hands-on excercises to design, generate and interpret CRISP/Cas mutations and gene replacement strategies and 3) a final workshop to present and discuss the results obtained.

Curso práctico basado en la detección de productos génicos en el desarrollo utilizando técnicas de microscopía confocal y análisis de imágenes. Se trabajará en un laboratorio, en un servicio de microscopía confocal, en cámaras de cultivo celular, y se analizaran los resultados con programas FIJI y Imaris. 

Las técnicas que se aprenden incluyen análisis de la expresión génica en desarrollo, FRAP, co-localización, en análisis de imágenes en 3D.

Todas las preparaciones las realizan los estudiantes y todos los estudiantes aprenden a utilizar un microscópio confocal básico. Los alumnos preparan varios tipos de embriones y tejidos en desarrollo marcados con distintas moléculas fluorescentes. A partir de las imágenes obtenidas por ellos un trabajo de análisis de bio-imágenes les permite discutir los resultados obtenidos. Los estudiantes trabajan en grupos reducidos de 2-3 alumnos.

El curso concluye con una exposición de los resultados de todos los grupos.

 

Este curso práctico introduce los aspectos más relevantes del análisis y la interpretación bioinformática de experimentos genómicos de secuenciación (p.e. ChIP-seq y RNA-seq). Se introducen desde las herramientas básicas de visualización a escala genómica hasta las aplicaciones de análisis puntual a nivel de secuencia reguladora, dentro de un contexto de trabajo interactivo que fomenta la
participación de los estudiantes sin necesidad previa de conocimientos de programación.

En este curso se trabajarán conceptos de Genómica para introducir algunos conceptos básicos de programación y herramientas computacionales que nos facilitaran la automatización de los análisis; esto nos permitirá repetir (obteniendo los mismos resultados a partir de un programa o protocolo), reproducir (pudiendo replicar los análisis de un trabajo previo o de una ya publicado), y reutilizar (adaptando el código o el protocolo a nuevos conjuntos de datos o para resolver nuevos problemas). Nos centraremos en el intérprete de comandos de Unix, el "shell" de "bash", también en el "shell" de "R", así como en algunas herramientas generales para procesar ficheros de datos y las versiones en línea de comandos de programas especializados en el análisis de secuencias (como por ejemplo el BLAST o los programas de predicción de genes). Se trabajará con ejemplos a lo largo del curso para ilustrar cómo estas herramientas y procesos se pueden integrar en protocolos bioinformáticos donde se describen todos los pasos de un experimento de la Biología Computacional. 

Este curso tiene una parte práctica sobre la formación del patrón y el crecimiento. Los estudiantes utilizarán cepas transgénicas de Drosophila para modificar la expresión de morfógenos mediante el sistema transactivador Gal4/UAS. Los resultados de los experimentos se observan e interpretan en las discusiones del laboratorio de prácticas.

Estas imágenes han sido tomadas por los alumnos del curso 2020-2021.

Curso predominantemente práctico que introduce las herramientas computacionales más avanzadas, tanto para la inferencia de la historia demográfica y evolutiva de las poblaciones y las especies, como para determinar las consecuencias funcionales de las mutaciones, a partir de datos genómicos. Estos conocimientos fundamentales tienen una gran aplicabilidad en la genética, biomedicina y en los estudios de biodiversidad.

Imagen: Visualización interactiva de un análisis global reciente (marzo 2022) de la evolución de los genomas de SARS-CoV-2 (fuente: nextstrain.org), ejemplo biológico que utilizaremos como caso de estudio práctico durante el curso.

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