Notícies
Inici  >  Notícies > Una plataforma de dades multinacional, a disposició dels experts en ciència...

Una plataforma de dades multinacional, a disposició dels experts en ciència cardiovascular

 

 

06/04/2021

Recerca

El projecte euCanSHare, finançat per la Unió Europea i el Canadà, ha llançat la primera plataforma internacional per compartir dades sobre cardiologia. Implementat per disset socis i dirigit per la Universitat de Barcelona i la Societat Europea de Cardiologia (ESC), el projecte permetrà als investigadors en cardiologia usar la plataforma per trobar, desar i analitzar informació.

La plataforma euCanSHare reuneix informació sobre més d’un milió d’individus de trenta-cinc cohorts cardiovasculars de la Unió Europea i el Canadà, entre d’altres. La iniciativa vol accelerar la recerca en medicina personalitzada per a malalties cardiovasculars i promoure l’intercanvi d’informació, alhora que redueix les fronteres culturals, tecnològiques i de conducta respecte a la ciència oberta.

El coordinador del projecte, Karim Lekadir, investigador postdoctoral Ramón y Cajal de la Facultat de Matemàtiques i Informàtica de la UB, explica que «euCanSHare és un esforç sense precedents per crear una plataforma internacional d’informació molt esperada, que facilitarà a les institucions una manera més responsable i eficient de compartir i explotar els estudis de recerca en cardiologia a gran escala». La plataforma permetrà l’accés a la informació de dades sobre cardiologia, i augmentarà la confiança mitjançant mecanismes de gestió de dades segurs.

«euCanSHare ofereix mecanismes de govern i privacitat per a un ús secundari de dades», destaca Bartha Maria Knoppers, de la Universitat McGill (Canadà), que dirigeix el treball sobre ètica i interoperabilitat juntament amb Pascal Borry, de la Universitat Catòlica de Lovaina (Bèlgica).  

La plataforma, que s’allotja al núvol del Centre de Supercomputació de Barcelona (BSC), reuneix, d’una banda, metadades sobre factors socials i demogràfics, i de l’altra, metadades òmiques (ADN, ARN, proteïnes) i d’imatge cardíaca, d’estils de vida i dades clíniques que inclouen resultats.

Les malalties cardiovasculars són la principal causa de mort a tot el món: la cardiopatia isquèmica i l’ictus van ser la raó de la majoria de morts l’any 2019. La major part dels atacs de cor i dels ictus es poden prevenir amb un estil de vida saludable, que inclogui activitat física i una dieta nutritiva, control del pes, i no fumar. El tractament és més eficaç quan hi ha una detecció precoç de la problemàtica, i quan la teràpia s’adapta a cada pacient. 

Els tractaments personalitzats es basen en el descobriment de biomarcadors que identifiquen qui té risc de patir una malaltia cardiovascular i qui respondrà a una teràpia determinada. La recerca en aquest camp requereix grans quantitats de dades de cardiologia, que inclouen dades moleculars, d’imatge i clíniques, així com informació demogràfica de població heterogènia i cohorts de pacients.  Tot això presenta reptes fonamentals per a l’emmagatzematge, la gestió i l’anàlisi de dades, capacitat de tecnologies de la informació (IT capacity) i accessibilitat. Aquests són els desafiaments que s’han abordat en el projecte euCanSHare, el catàleg de dades cardiovasculars més complet fins ara.   

Steffen Petersen, professor de la Universitat Queen Mary de Londres (Regne Unit) i president electe de l’Associació Europea d’Imatge Cardiovascular (EACVI), explica com es beneficiaran els seus estudis d’euCanSHare: «La meva recerca se centra en la prevenció, el diagnòstic i el tractament de la insuficiència cardíaca en pacients amb risc de diabetis: mitjançant diverses cohorts d’euCanSHare, incrementaré el poder estadístic de la meva recerca i això m’ajudarà a analitzar més a fons el paper de l’estil de vida, l’ètnia i la genètica».   

La plataforma euCanSHare cobreix tot el recorregut de la recerca, des de l’accés a les dades fins a la distribució dels resultats. Les funcions de la plataforma inclouen: 1) un cercador i catàleg que permeti als professionals buscar cohorts per fer-les servir en les seves investigacions; 2) una interfície del gestor amb accés controlat que permeti donar credencials i demanar permís per utilitzar la informació seleccionada (que es publicarà l’any que ve); 3) una eina de gestió per introduir noves dades; 4) un espai de treball per a usuaris autoritzats per analitzar dades, i 5) instruccions i suport tècnic per oferir ajuda als nous usuaris de la plataforma. 

En concret, el catàleg ofereix una descripció detallada dels conjunts de dades que hi ha disponibles, que inclou variables clau, polítiques d’accés i estat d’harmonització entre cohorts. En la versió actual, el catàleg ofereix informació sobre 310.000 individus de trenta estudis.

Josep Lluís Gelpi, membre del consorci euCanSHare i del Centre de Supercomputació de Barcelona, afegeix que «la plataforma està entrellaçada amb infraestructures de dades establertes, com l’Arxiu Europeu del Genoma-Fenoma (EGA) i la Infraestructura Europea de Recerca en Tecnologies de la Imatge en Ciències Biològiques i Biomèdiques (Euro-BioImaging), per millorar i estandarditzar la introducció, la seguretat i l’harmonització de dades, i per compartir procediments».

 

Consorci euCanSHare

El consorci euCanSHare està integrat pels membres següents:

1. Universitat de Barcelona (coordinadora del projecte)

2. Institut de Recerca del Centre Mèdic de la Universitat McGill (Canadà)

3. Hospital Universitari d’Hamburg-Eppendorf (Alemanya)

4. Lynkeus (Itàlia)

5. Centre Mèdic Universitari Erasme de Rotterdam (Països Baixos)

6. Universitat Queen Mary de Londres (Regne Unit)

7. Centre de Genòmica i Política de la Universitat McGill (Canadà)

8. Universitat Catòlica de Lovaina (Bèlgica)

9. Centre de Supercomputació de Barcelona (Espanya)

10. Centre de Regulació Genòmica (Espanya)

11. Societat Europea de Cardiologia (França)

12. Infraestructura de Recerca sobre Biobancs i Recursos Biomoleculars - Consorci Europeu d’Infraestructures de Recerca (BBMRI-ERIC, Àustria)

13. Institut de Recerca en Salut de la Població de la Universitat McMaster (Canadà)

14. Institut Nacional de Salut i Benestar (Finlàndia)

15. Hospital Universitari Greifswald (Alemanya)

16. Nostrum Biodiscovery (Espanya)

17. Universitat Pompeu Fabra (Espanya)

Comparteix-la a:
| Més |
  • Segueix-nos:
  • botó per accedir al facebook de la universitat de barcelona
  • botó per accedir al twitter de la universitat de barcelona
  • botó per accedir a l'instagram de la Universitat de Barcelona
  • botó per accedir al linkedin de la Universitat de Barcelona
  • botó per accedir al youtube de la universitat de barcelona
  • botó per accedir al google+ de la universitat de barcelona
  • ??? peu.flickr.alt ???
Membre de la Reconeixement internacional de l'excel·lència HR Excellence in Research logo del ∞ - League of European Research Universities logo del bkc - campus excel·lència logo del health universitat de barcelona campus

© Universitat de Barcelona