Notícies
Inici  >  Notícies > Es crea la base de dades pública més gran coneguda fins ara de variants genètiques...

Es crea la base de dades pública més gran coneguda fins ara de variants genètiques que regulen l’expressió de gens al còlon

 

 

14/04/2021

Recerca

Una col·laboració entre investigadors catalans i dels Estats Units ha permès crear el banc públic més gran conegut fins ara de dades sobre expressió de gens i variants genètiques al còlon. Aquesta base de dades, que recull l’anàlisi de més de 400 biòpsies de còlons sans, és el resultat d’un treball liderat per experts del Programa d’Anàlisi de Dades Oncològiques de l’Institut Català d’Oncologia (ICO), el Grup de Recerca en Càncer Colorectal de l’IDIBELL, la Universitat de Barcelona i el CIBER d’Epidemiologia i Salut Pública (CIBERESP), amb la col·laboració del grup de recerca que dirigeix Graham Casey, del Centre de Recerca en Salut Pública Genòmica de la Universitat de Virgínia (EUA). Els resultats de la recerca s’han publicat a la revista Cellular and Molecular Gastroenterelogy and Hepatology, en un article dirigit per Víctor Moreno (ICO-IDIBELL-UB-CIBERESP).

Identificar els nivells d’expressió dels gens en teixits sans és clau per entendre per què hi ha variants genètiques associades a malalties, com el càncer. En aquest sentit, el projecte «University of Barcelona and University of Virginia genotyping and RNA sequencing project» (BarcUVa-Seq) ha desenvolupat una eina interactiva que posa a disposició pública la informació obtinguda, de manera que es poden explorar fàcilment les dades de l’estudi sobre l’expressió genètica del còlon i les associacions amb variants genètiques. En concret, la base de dades permetrà generar hipòtesis, entendre la funció de marcadors genètics ja associats amb el risc de patir una malaltia dels quals no es coneixen els mecanismes moleculars, i prioritzar els gens i les variants genètiques en què es puguin focalitzar recerques futures.

Així mateix, gràcies a les biòpsies analitzades a l’estudi, s’han identificat variants genètiques que regulen l’expressió de gens involucrats en malalties del còlon, com el càncer colorectal o malalties inflamatòries, però també d’altres òrgans, com el cervell, fet que ha evidenciat la relació que té aquest amb l’intestí. Per exemple, s’ha comprovat que una part dels marcadors genètics associats a l’esquizofrènia estarien regulant gens al còlon. A més, a l’estudi es proposen nous gens associats probablement amb aquestes malalties.

BarcUVa-Seq: un projecte innovador

Aquest estudi neix de la col·laboració amb investigadors dels Estats Units amb l’objectiu principal de generar una base de dades epidemiològiques de referència per entendre la biologia de les cèl·lules epitelials del còlon (origen del càncer colorectal) i la seva relació amb factors genètics i ambientals.

Concretament, el projecte BarcUVa-Seq inclou dades de 485 persones voluntàries de la Regió Metropolitana Sud, reclutades a l’Hospital Universitari de Bellvitge i a l’Hospital de Viladecans i sense cap lesió al còlon. Les dades s’han recollit en els últims cinc anys durant una colonoscòpia de cribratge rutinari. De fet, les dimensions elevades de la mostra i l’homogeneïtat en la seva recol·lecció aporten un valor afegit a aquesta recerca, ja que no es coneix cap altre estudi publicat fins ara amb aquestes característiques.

 

Comparteix-la a:
| Més |
  • Segueix-nos:
  • botó per accedir al facebook de la universitat de barcelona
  • botó per accedir al twitter de la universitat de barcelona
  • botó per accedir a l'instagram de la Universitat de Barcelona
  • botó per accedir al linkedin de la Universitat de Barcelona
  • botó per accedir al youtube de la universitat de barcelona
  • botó per accedir al google+ de la universitat de barcelona
  • ??? peu.flickr.alt ???
Membre de la Reconeixement internacional de l'excel·lència HR Excellence in Research logo del ∞ - League of European Research Universities logo del bkc - campus excel·lència logo del health universitat de barcelona campus

© Universitat de Barcelona