El proyecto Biogenoma impulsa cuatro proyectos del IRBio para secuenciar el genoma de especies eucariotas

 

Barcelona 9 de noviembre de 2020. El proyecto Biogenoma de Cataluña impulsará cuatro proyectos del Instituto de Investigación de la Biodiversidad (IRBio) en el marco de la convocatoria del Earth BioGenome Project (EBP), que ha sido impulsada a través del Instituto de Estudios Catalanes (IEC) junto con dos de sus sociedades filiales, la Sociedad Catalana de Biología (SCB) y la Institución Catalana de Historia Natural (ICHN).

El Earth BioGenome Project es un proyecto de proyección internacional para obtener la secuencia del genoma de todas las especies eucariotas de la Tierra, un hito científico que será clave para revertir o controlar el impacto de la actividad humana en la biosfera.

La convocatoria financiará un total de ocho proyectos con un presupuesto máximo de 10.000 € cada uno, que podrán destinarse a trabajo de campo, catalogación, secuenciación genómica, ensamblaje y anotación.

 

Proyectos financiados:

The genome of the Catalán blind scorpion

Miquel Arnedo -IRBio

Departamento de Biología Evolutiva, Ecología y Ciencias Ambientales

FACULTAD DE BIOLOGÍA UB

Los escorpiones son un linaje icónico de artrópodos que, debido a su veneno y plan corporal característico, han fascinado al ser humano desde la antigüedad. El escorpión ciego, Belisarius xambeui, es un endemismo del Pirineo y pre-Pirineo catalán. Por sus inciertas relaciones evolutivas, escasas observaciones en la naturaleza y morfología aberrante, se le considera el escorpión más raro de Europa. La secuenciación de su genoma no sólo nos permitirá conocer mejor su parentesco evolutivo, sino que nos ayudará a entender las bases genéticas de los cambios morfológicos y la evolución de los venenos, así como determinar aspectos relevantes de su dinámica poblacional que son esenciales para su conservación.

Fotos: Marc Domenech

 

Podarcis lilfordi s genome

Laura Baldo - IRBio

Departamento de Biología Evolutiva, Ecología y Ciencias Ambientales

FACULTAD DE BIOLOGÍA UB

Giacomo Tavecchia - CSIC, Instituto Mediterráneo de Estudios Avanzados (IMEDEA)

La lagartija de Baleares, Podarcis lilfordi, es una especie endémica y emblemática de las islas Baleares. La especie comprende una multitud de poblaciones confinadas en varios islotes de las costas de Mallorca, Menorca y Cabrera. La gran diversidad en morfología, pigmentación, ecología y rasgos de la historia de vida de estas poblaciones aisladas hace de la especie P. lilfordi un modelo genómico excelente para estudios de genética, demografía y selección natural. Actualmente, la especie figura en peligro de extinción por criterios de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN), lo que convierte la secuenciación del genoma en una herramienta importante para su conservación.

Fotos: Joan Lluis Riera

 

The "morruda" (Diplodus puntazzo) genome

Carlos Carreras - IRBio

Departamento de Genética, Microbiología y Estadística

FACULTAD DE BIOLOGÍA UB

(Cast: sargo picudo, eng: sharpsnout seabream)

La morruda es un pez demersal común en el Mediterráneo bien conocido por los pescadores y submarinistas de nuestras costas. Tiene un papel importante en los ecosistemas costeros, ya que se alimenta de una gran variedad de organismos todo incluyendo especies tóxicas como las esponjas, los equinodermos o los celentéreos. Por su rápido crecimiento, se ha perfilado como una potencial especie de interés para el sector de la acuicultura. Además, pertenece al grupo polifilético de los espáridos, un taxón del cuando sólo se ha secuenciado hasta ahora el genoma de una única especie (Sparus aurata). La secuenciación del genoma de la Morruda nos proporcionará una herramienta fundamental para futuros estudios de este habitante de nuestras costas.

Foto: Enrique Ballesteros

 

The genome of Pyrenean Chamomile (Achillea ptarmica subsp. pyrenaica)

Teresa Garnatje - Instituto Botánico de Barcelona (IBB, CSIC-Ayuntamiento de Barcelona)

Joan Vallès - IRBio

Laboratorio de Botánica, Departamento de Biología, Sanidad y Medio Ambiente

FACULTAD DE FARMACIA Y CIENCIAS DE LA ALIMENTACIÓN UB

El grupo de investigación EtnoBioFiC, del Instituto Botánico de Barcelona -un centro mixto del CSIC y del Ayuntamiento de Barcelona- y de la Universidad de Barcelona y el IRBio, liderará la secuenciación del genoma de la manzanilla de montaña (Achillea ptarmica subsp. pyrenaica), una especie emblemática del territorio y de gran relevancia por sus usos medicinales, alimenticios y cosméticos.

Foto: Joan Vallès

 

Proyecto en reserva:

Genome sequencing of Carpodesmia mediterranea (Sauvageau)

Jordi Rull Lluch - IRBio

Amelia Gómez Garreta - IRBio

Rafael Martín Martín - IRBio

Laboratorio de Botánica, Departamento de Biología, Sanidad y Medio Ambiente

FACULTAD DE FARMACIA Y CIENCIAS DE LA ALIMENTACIÓN UB

Se analizará el genoma de Carpodesmia mediterranea (Sauvageau) Orellana & Sansón (= Cystoseira mediterranea Sauvageau), un alga parda (Fucales, Phaeophyceae) ampliamente distribuida en las costas rocosas de los. Esta especie tiene gran importancia ecológica y forma poblaciones densas (praderas) superficiales (0-0.5 m de profundidad) en costas rocosas -poco inclinadas y moderadamente batidas- en ambientes de aguas limpias. Está considerada como una especie biondicadora de la calidad del agua marina y actualmente está protegida por el Convenio para la Protección del Mar Mediterráneo y la Biodiversidad (Convenio de Barcelona).

Foto: Jordi Rull