El Dr. Aguilar és catedràtic del Departament de Biologia Animal i director de l'Institut de Recerca de la Biodiversitat de la UB (IRBio), director del Grup de Recerca de Grans Vertebrats Marins de la UB, i pioner a Espanya en la investigació sobre l'impacte d'agents químics contaminants en els ecosistemes marins i en la conservació dels mamífers marins.

El llibre "Chimán. La pesca ballenera moderna en la península Ibérica" (Publicacions i Edicions de la UB, 2013), és el darrer treball d'Àlex Aguilar, una obra que destil·la la seva experiència amb aquests grans mamífers marins al llarg de trenta-cinc anys d'activitat investigadora.