Un dels objectius de l'Institut és afavorir la transferència de coneixements i resultats de la recerca a persones físiques i entitats públiques o privades a partir de projectes que impliquin un plantejament interdisciplinari.
Per això, pretén consolidar i potenciar les col·laboracions entre els seus grups i amb altres institucions.
Aquesta estratègia permetrà comprendre millor el funcionament dels sistemes aquàtics, preveure’n les disfuncions o els impactes derivats de la pressió antròpica, fer valoracions de risc i analitzar els aspectes socioeconòmics relacionats amb la seva gestió.