a) Col·locar el tub de mostra en un dels receptacles del rotor.

b) Compensar el tub de mostra col·locant en el receptacle diametralment oposat un altre tub amb el mateix volum de líquid que el tub de mostra.

c) Tancar hermèticament el compartiment del rotor i posar el funcionament la centrífuga. Una vegada acabada la centrifugació (normalment les centrífugues tenen un temporitzador que desconnecta automàticament el motor quan ha transcorregut el temps programat), cal esperar que es detingui el rotor per obrir-ne la tapa del compartiment i treure el tub de mostra i el de compensació.